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藻类病毒根据宿主的不同，藻类病毒可分为蓝藻病毒和真核藻病毒。蓝藻病毒与噬菌体的形态、结构、分子组成以及对宿主的感染方式极为相似，被归为噬菌体一类，因而也常被称作“噬蓝藻体”或“噬藻体”[2]；真核藻病毒是一大类病毒，绝大多数为多角体粒子，通常被称作“藻病毒”，它们是完全不同于蓝藻病毒或噬藻体的病毒类型。1.1 蓝藻病毒1.1.1 蓝藻病毒的分类根据病毒体形态的不同，国际病毒学分类委员会 (ICTV) 细菌病毒分会参照噬菌体的分类方式，将 蓝 藻 病 毒 分 为 三 大 类： 肌 尾 噬 菌 体 科(Myoviridae)，其特征是含有一条中央管和能伸缩的尾巴，常见的如AS-1，N-1，A-1(L)，A-2 等；长尾噬菌体科 (Styloviridae)，其特征是含有长的、不能伸缩的尾巴，如 S-1，S-2L，SM-2 等；短尾噬菌体科 (Podoviridae)，其尾巴较短，如 LPP-1，LPP-2，SM-1，A-4(L)，AC-1 等。1.1.2 蓝藻病毒的感染特点由于丝状和单细胞两种基本形态的蓝藻细胞新陈代谢差异较大，蓝藻病毒在两种宿主中的感染和复制明显不同。丝状蓝藻被病毒感染后，细胞超微结构迅速遭到破坏，CO2的固定被封锁，宿主的DNA 被降解，内含物渗出细胞，宿主细胞中很快产生一种由类囊体光合片层内陷形成的特殊结构，即所谓的“病毒生长基质空间”(virogenic stromaspace)，该 部位将成为病毒繁殖的场所；单细胞蓝藻受到病毒感染后，细胞的超微结构并不发生显著的变化，CO2的固定也并不受到影响，病毒的复制在核质中完成。这两类病毒的生活史和复制周期差异也较为悬 殊，丝状蓝藻病毒一般在 3～5 h 内完成感染并释放出大量的病毒粒子，而单细胞蓝藻病毒的复制时间则长得多。

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